Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM3Q96MX0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms