Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms