Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms