Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C12orf42Q96LP6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C12orf42Q96LP6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms