Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms