Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms