Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms