Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF185Q96GF1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms