Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms