Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM52Q96A61 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms