Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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