Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GIPC3Q8TF64 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms