Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL11Q8NHH1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms