Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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CNNM3Q8NE01 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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