Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms