Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms