Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2LQ8IYA6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms