Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms