Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF23Q7RTU1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF23Q7RTU1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms