Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMUB2Q71RG4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms