Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP50Q70EL3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms