Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms