Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms