Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG3Q6UXM1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms