Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUSD1Q6UWL2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms