Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms