Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC137Q6PK04 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms