Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms