Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms