Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms