Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF628Q5EBL2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF628Q5EBL2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF628Q5EBL2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms