Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms