Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms