Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms