Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms