Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPROQ16827 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPROQ16827 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPROQ16827 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPROQ16827 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPROQ16827 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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