Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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