Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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