Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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