Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms