Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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