Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms