Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP1BQ14684 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP1BQ14684 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms