Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX2Q13950 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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