Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms