Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms