Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms