Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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