Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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