Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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